histones and transcriptional repression

Histones and transcriptional repression

Question:

The amino acid side chains of the four histones in the nucleosome are subjected to remarkable variety of post-translation modifications such as phosphorylation, acetylation and methylation. Which one of the following post-translational marks on histone tails is usually associated with transcriptional repression?

  1. Acetylation of H3K9
  2. Methylation of H3K9
  3. Acetylation of H4K5
  4. Phosphorylation of H3S10

Rephrasing the question:

Which post-translational modification is associated with histones and transcriptional repression?

Answer:

Methylation of Histone 3 at the 9th lysine (H3K9) causes transcriptional repression (option 2).

Explanation:

histones and transcriptional repression

Histones are the proteins that DNA is coiled around to (a) keep it compact, and (b) regulate its expression. Post-translational modifications can be made to histones to regulate how tightly DNA is wound around them, and thus to regulate how much transcription a gene in that area undergoes. (This falls under epigenetics.)

There are 5 families of histones: H1/H5, H2A, H2B, H3, and H4. H1/H5 are known as linker histones and the remaining four are known as core histones. This is because the core histones form the body of the nucleosome (two dimers of H2A + H2B, with a tetramer of H3 + H4) around which the DNA wraps. The linker histones bind the portion of DNA where it starts to wraps around the nucleosome and the portion where it stops wrapping around the nucleosome; in effect, it ‘locks’ the structure and position of the DNA around the nucleosome.

There are a number types of modifications a histone can undergo. These usually happen at the N-terminus ‘tail’ of the histone which sticks out from the main protein body, is rich in lysine (K) and arginine (R), and is highly positively charged.

The two most important modifications are methylation and acetylation. These are used to regulate gene expression. Other types of modifications, such as phosphorylation, SUMOylation, and ubiquitination, modify histone action, localization, and degradation.

There is a shorthand to describe such modifications. This is:

Histone number + amino acid on which modification occurs + type of modification + number of such modifications

So, for instance, H3K9Me1 means that on Histone 3 (H3), on its lysine-9 residue (K9), there is a single (1) methylation (Me).

Now, what do these modifications do? First let’s look at acetylation. This is the addition of a negatively-charged acetyl group to a lysine residue, which reduces the overall positive charge of the histone. Since DNA is negatively charged, making the histone less positive (= more negative) makes the DNA bind less tightly to the histone. This ‘more free’ DNA can then be transcribed more easily; so acetylation leads to transcriptional activation.

Next we have phosphorylation of serine, threonine, or tyrosine side-chains. Phosphate groups are also negatively charged, so histone phosphorylation also results in transcriptional activation. (It also has other roles, such as in DNA repair and chromatin condensation.)

Histone methylation is the addition of one or more methyl groups to lysine or arginine. Methylation of some amino acids causes gene activation, while methylation of other residues causes repression. This is because methylation does not have a straightforward effect on the charge of the histone. The effect it has depend on how other proteins recognize the methylated vs. non-methylated histones.

Luckily, in this question, there is only one option with methylation! So, option 2, the methylation of the lysine-9 residue of histone 3 will result in transcription repression.

Sources:

Histone at Wikipedia

Bannister AJ and Kouzarides T. (2011) Regulation of chromatin by histone modification. Cell Research 21, 381-395.

37 thoughts on “Histones and transcriptional repression”

  1. Does running a blog like this take a large attention-grabbing discussion is worth comment.
    It’s difficult to find knowledgeable people using the same blog platform 바카라사이트”Anyways I am here now and would just like to say thank you for a marvelous post It’s on a completely different subject but it has pretty much the same layout and design.

  2. hello there
    i have learn several just right stuff here. Definitely value bookmarking for revisiting.Aspectmontage makes it easy as can be and affordable for you to upgrade your windows, doors, roofing, showers or baths. “강남오피” this is kind of off topic but I need some guidance from an established blog. I will be coming back to your website for Perfect piece of work you have done, this internet site is really cool with wonderful info.

  3. i have learn several just right stuff here. Definitely value bookmarking for revisiting Aspectmontage makes it easy as can be and affordable for you to upgrade your windows, doors, roofing, showers or baths“오피뷰”’m really impressed with your writing skills and also indow replacement Boston In addition to installing abode improvement products that compel your serene,

  4. i have learn several just right stuff here. Definitely value bookmarking for revisiting.
    I wonder how so much effort you place to make one of these fantastic informative web site.
    온라인카지노” m really impressed with your writing skills and
    We finalize our work space and hamper within your budget
    , no matter what kind of programme you have in mind!

  5. I like your blog it’s very good and informative , I do believe this is a great website. I stumbledupon it 😉 I’m going to return once again since I bookmarked it. Money and freedom is the greatest way to change 카지노사이트 Appreciate the helpful information Would you propose starting with a free platform like WordPress

  6. pg slotมากมาย เล่นง่ายจ่ายจริง แตกจริง ต้อง pg slot เท่านั้น! เล่นสล็อต พีจีสล็อต เว็บไซต์ตรงผู้ให้บริการเกมสล็อตออนไลน์ชั้นหนึ่ง ทกลอง เล่น ฟรี พร้อมโบนัส

  7. Jadwal Liga Europa Malam Ini di SCTV menawarkan pengalaman menonton yang tak terlupakan bagi penggemar sepak bola. SCTV menghadirkan pertandingan-pertandingan pilihan dari Liga Europa, di mana klub-klub Eropa terbaik bersaing memperebutkan gelar bergengsi. Saksikan aksi-aksi seru dan dramatis dari lapangan hijau, dengan liputan langsung yang informatif dan komentar ahli yang menghidupkan setiap momen. Jadwal hari ini di SCTV menyediakan informasi lengkap mengenai pertandingan, termasuk detail waktu, tim yang bertanding, dan prediksi hasil. Jangan lewatkan kesempatan untuk menyaksikan pertandingan Liga Europa secara langsung. Kunjungi situs web kami sekarang untuk mendapatkan jadwal lengkap dan tetap terhubung dengan Liga Europa malam ini di SCTV!

  8. Fun88 เป็นเว็บไซต์การพนันออนไลน์ชั้นนำของเอเชียที่นำเสนอเกมที่หลากหลาย รวมถึงการพนันกีฬา คาสิโนออนไลน์ ลอตเตอรี่ สล็อต และอื่นๆ อีกมากมาย เมื่อเข้าสู่ระบบ Fun88 ผู้เล่นจะเข้าสู่แพลตฟอร์มที่ทันสมัยพร้อมผลิตภัณฑ์ที่หลากหลายให้เลือก เว็บไซต์เสนอราคาเดิมพันที่ดีที่สุดพร้อมทั้งโปรโมชั่นที่น่าสนใจมากมาย
    ทางเข้าล่าสุด:เว บ พน น fun88

  9. ขอบคุณสำหรับการแบ่งปันและยินดีต้อนรับสู่ Fun88 แพลตฟอร์มทันสมัยที่ผู้เล่นจะเพลิดเพลินไปกับประสบการณ์ผลิตภัณฑ์ที่หลากหลายและหลากหลาย
    ทางเข้าล่าสุด:
    แทงหวยเว บ fun88

  10. Hasil Friendly Match memberikan informasi terbaru tentang hasil pertandingan sepak bola persahabatan di seluruh dunia. Pertandingan friendly match tidak hanya menjadi kesempatan bagi tim untuk mempersiapkan strategi dan keterampilan mereka, tetapi juga menjadi ajang untuk menguji kekuatan dan kemampuan di lapangan hijau. Situs kami memberikan update langsung mengenai skor akhir, pencetak gol, serta analisis singkat dari setiap pertandingan. Dapatkan insight tentang performa tim-tim favorit Anda dalam pertandingan yang santai namun penuh semangat ini.

  11. Mainkan game sepak bola offline terbaik di game sepak bola offline! Kami memiliki koleksi game sepak bola offline yang mengasyikkan dan bisa dimainkan tanpa koneksi internet. Di situs kami, Anda akan menemukan berbagai pilihan permainan sepak bola dengan grafis yang memukau dan kontrol yang mudah dipelajari. Rasakan pengalaman bermain sepak bola layaknya di lapangan sungguhan, dengan mode permainan yang beragam untuk memenuhi selera dan keinginan Anda. Nikmati keseruan bermain game sepak bola di mana saja dan kapan saja, tanpa harus khawatir tentang sinyal atau kuota internet. Ayo bergabung dan mulailah petualangan seru Anda dalam dunia game sepak bola offline bersama kami!

  12. Jangan lewatkan momen-momen menegangkan ini! Pantau terus klasemen terbaru dan jadwal pertandingan FA Cup untuk mengikuti setiap gol, tendangan penalti, dan kisah heroik yang akan dikenang dalam sejarah sepak bola. Tunjukkan dukungan Anda kepada tim kesayangan dan rasakan semangat kompetisi ini menggebu-gebu di hati Anda.

    Segera kunjungi situs resmi Fa Cup klasemen! untuk informasi terbaru dan jangan ragu untuk bergabung dengan diskusi seru tentang pertandingan di media sosial kami. Jadilah bagian dari keseruan FA Cup sekarang juga!

  13. Fun88 เป็นเว็บไซต์การพนันออนไลน์ชั้นนำของเอเชียที่นำเสนอเกมที่หลากหลาย รวมถึงการพนันกีฬา คาสิโนออนไลน์ ลอตเตอรี่ สล็อต และอื่นๆ อีกมากมาย เมื่อเข้าสู่ระบบ Fun88 ผู้เล่นจะเข้าสู่แพลตฟอร์มที่ทันสมัยพร้อมผลิตภัณฑ์ที่หลากหลายให้เลือก เว็บไซต์เสนอราคาเดิมพันที่ดีที่สุดพร้อมทั้งโปรโมชั่นที่น่าสนใจมากมาย
    ทางเข้าล่าสุด:ดาวน โหลด fun88

  14. Yuk unduh aplikasi nonton bola gratis terbaik di sini! Nikmati streaming live pertandingan favoritmu dengan kualitas HD tanpa biaya. Dengan fitur yang mudah digunakan, kamu bisa menonton semua liga dan kompetisi sepak bola dari seluruh dunia langsung dari smartphone atau tabletmu. Jangan lewatkan gol-gol epik dan momen seru lainnya, di mana pun dan kapan pun! Ayo, segera download aplikasinya dan rasakan pengalaman menonton yang seru dan praktis secara cuma-cuma!
    aplikasi nonton bola gratis

  15. Saksikan pertandingan bola favoritmu secara langsung dengan live streaming bola gratis tanpa aplikasi! Dapatkan akses ke liga-liga top dunia dan nikmati kualitas HD tanpa perlu membayar. Aplikasi ini mudah digunakan, memungkinkan kamu menonton setiap gol dan momen penting secara real-time langsung dari perangkat mobilemu. Tidak perlu lagi ketinggalan pertandingan hanya karena tidak ada di depan TV. Unduh sekarang dan rasakan kemudahan serta kepraktisan menonton sepak bola kapan saja dan di mana saja, semua tanpa biaya tambahan! Jadi, jangan sampai terlewatkan, aplikasi ini wajib dimiliki bagi pecinta sepak bola sejati!

  16. Tonton acara seru di RCTI hari ini! Nikmati beragam program menarik mulai dari drama, komedi, hingga acara realitas yang menghibur. RCTI menawarkan hiburan berkualitas dengan jadwal yang penuh variasi untuk semua kalangan. Jangan lewatkan kesempatan untuk menikmati tayangan unggulan yang dapat menghibur dan menginspirasi sepanjang hari. Saksikanlah acara-acara favoritmu dengan kualitas gambar yang jernih dan suara yang memikat. Jadikan waktu luangmu lebih menyenangkan dengan menonton RCTI, saluran televisi terpercaya yang selalu memberikan pengalaman menonton yang memuaskan. Segera saksikan acara tv rcti hari ini dan rasakan sensasi hiburan yang tak terlupakan!

  17. Ikuti perkembangan terbaru dari hasil Liga Inggris Championship di sini! Dapatkan informasi terupdate tentang setiap pertandingan, skor, dan klasemen tim favoritmu. Liga Inggris Championship menawarkan persaingan yang seru dan ketat di lapangan, dengan klub-klub besar bersaing untuk meraih promosi ke Liga Utama Inggris. Jangan lewatkan momen menegangkan dan gol-gol spektakuler yang menghibur dari kompetisi sepak bola kelas dunia ini. Segera dapatkan semua informasi yang kamu butuhkan tentang Liga Inggris Championship di situs atau aplikasi favoritmu, dan jadilah bagian dari penggemar sepak bola yang selalu up to date!
    hasil liga inggris championship

  18. Yuk simak klasemen terbaru Liga Championship Inggris! Liga ini merupakan panggung bagi klub-klub dengan talenta luar biasa yang berkompetisi untuk meraih promosi ke Liga Primer Inggris. Dari klub-klub legendaris hingga tim-tim pendatang baru yang berpotensi, Liga Championship Inggris menawarkan persaingan yang sangat ketat dan penuh gairah. Pantau peringkat klub-klub favorit Anda setiap minggunya dan saksikan bagaimana mereka berjuang untuk mendapatkan posisi teratas. Klasemen ini tidak hanya memberikan gambaran tentang posisi klub-klub, tetapi juga menghadirkan momen-momen menegangkan dan gol-gol spektakuler yang tak terlupakan. Jangan lewatkan kesempatan untuk mendukung klub kesayangan Anda dalam perjalanan mereka menuju sukses di Liga Championship Inggris. Ayo saksikan aksi-aksi seru dan dukung tim favorit Anda sepanjang musim ini!
    klasemen liga inggris championship

  19. france ligue 1 klasemen! Bergabunglah dalam kegembiraan kompetisi sepak bola paling prestisius di Prancis. Nikmati aksi-aksi spektakuler dari para bintang terbaik dunia yang berlaga di lapangan hijau. Dukung tim favoritmu dan rasakan semangat persaingan yang membara hingga akhir musim. Jangan lewatkan momen-momen menegangkan dan gol-gol memukau yang hanya bisa Anda temui di France Ligue 1. Segera cek klasemen terbaru dan jadwal pertandingan di situs resmi France Ligue 1. Jadilah bagian dari cerita kejuaraan yang tak terlupakan!

  20. klasmen liga perancis Liga ini menawarkan persaingan sepak bola yang menarik dan penuh prestasi dari klub-klub terbaik. Dukung tim favoritmu dalam perjalanan mereka menuju puncak klasemen dan nikmati aksi-aksi seru yang tiada henti. Jangan lewatkan momen-momen dramatis dan gol-gol spektakuler yang hanya bisa Anda temui di Liga Perancis. Cek klasemen terbaru serta jadwal lengkap pertandingannya di situs resmi Liga Perancis. Ayo bergabung dalam semangat kompetisi yang membara dan buktikan dukungan Anda untuk tim kesayangan!

  21. Saksikan secara langsung streaming gratis Piala Dunia 2022 di SCTV! Nikmati setiap momen epik dari kompetisi sepak bola terbesar di dunia langsung dari kenyamanan rumah Anda. Jangan lewatkan kesempatan untuk mendukung tim favorit dan menyaksikan aksi para bintang dunia di lapangan hijau. Ayo bergabung dalam semangat suporter sepak bola di seluruh Indonesia dan ikuti semua pertandingan seru melalui live streaming eksklusif SCTV. Pastikan Anda terhubung dengan SCTV untuk mendapatkan pengalaman menonton yang memikat dan tidak terlupakan dari Piala Dunia 2022!
    live streaming piala dunia 2022 gratis sctv

Leave a Comment

Your email address will not be published.